《大漠之战》主要讲述在国境线上，考古队长郑文初(卢森堡饰)邀请武装部队给予文物保护。　　同时考古队在挖掘过程中发现了地下墓室，在庆功之余发生了变异事件，其中一名考古队员突然变异，郑文初不相信诅咒之类的说法，在寻找真相途中，却爆发了更大规模的变异，武装部队不得已进行反击。　　就在这人人自危的时刻，却有人坐怀不乱悄悄地将文物进行转移…….

解放初期，在队长郑文初和顾问梁锦文的带领下，考古队发掘了一个具有千年历史的琮式瓶，据说里面藏着有关西夏宝藏的秘密，因此引来了各路人马的争抢寻找救援中郑文初发现，考古队员们的惨死和琮式瓶的失踪似乎都与队友梁锦文有关，而梁锦文却离奇失踪？出于不同的目的，几方势力踏上了寻宝之路，却在黑水镇燕军司的藏兵洞外短兵相见，一场混战在所难免……