某日，佐和子在路上遇见一名卖石头的男子，男子请她帮忙顾店后，送了一颗石头给她作为谢礼。另一方面，女儿康子和默默无闻的音乐人交往，并瞒着父母辞掉了正职到小酒吧工作。得知此事后的佐知子因担心女儿而前往其住处，两人因而起了争执。突然间雷声大作，房间变得昏暗不已，灯再亮起时，却交换了身体……

　　21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。　　几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护，但三个巨像已被破坏剩一个，队员·大伍的战机也被击中，且逃生装置失灵。在危急关头，大伍突然化成光，和最后一个的石像结合。光之巨人“迪加”因此而复活，并与两大怪兽展开了战斗……